五军具体编制则如下：
哨为最基层的作战单位，步兵每十人编为一哨，设哨总一人
四个长枪哨、三个牌刀哨、二个火铳哨为一步兵队，设部总一人
四个步兵队、一个炮兵队为一步兵旅，设掌旅一人
骑兵旅编制较辖三个骑兵队，共三百骑，皆配马槊、腰刀和手铳炮兵旅则辖五个炮兵队，根据轻重炮的配比，拥有十门至二十余门轻重火炮
四个步兵旅、一个骑兵旅、一个炮兵旅为一步兵标四个骑兵旅、一个炮兵旅为一骑兵标皆设威武将军一人、都尉三人。
以上步兵标3000人，骑兵标2000人，都是基本战术兵团。原本特设的高达标，兵力则为3000人，扩编至五军中每军都拥有一个突破土木工事用的高达标。
每个师一般情况下，是由两个步兵标、一个骑兵标及若干师直属部队组成，一师约万人左右，皆设制将军一人、果毅将军一人掌握。
最终兵力及编制为：军、师、标、旅、队、哨。
至于五军，自然皆由权将军掌兵。
原本五营中的中营，改称殿前军，原本五营中的前营，则加强为殿中军。五军具体将领则如下：
殿中军：权将军郭君镇，制将军郝摇旗、张皮绠、陈永福、苗里琛、李世威
殿左军：权将军刘芳亮，制将军刘汝魁、马世耀、牛成虎
殿右军：权将军袁宗第，刘体纯、袁宗道、李破虏
殿前军：权将军谷可成，党守素、马宝、任继荣
殿后军：权将军高一功，制将军马重禧、赵应元、张洪。
其余还有贺珍、马进忠、袁时泰、路应标、冯养珠等人为地方卫军系统的制将军，地方卫军的编制较野战军较弱，其制将军也比较五军野战军的品级低半级。
刘希尧和蔺养成则为水师制将军，分别统率洞庭湖水师和长江水师两支部队。
大顺野战五军总兵力经过整编湖广援军以后，总兵力达到十七万有余地方卫军则在整编各路绿林豪杰武装以及动员湖广民兵以后，亦有六七万人以上。
如此，虽经获鹿之败，大顺军的总兵力依旧保有二十余万的较大规模，与清军此时收编北方明军和豪绅武装以后的总兵力二十五万人相比，正在慢慢占据兵力上的优势。
而且随着时间的推移，大顺军的兵力优势还会因为动员效率和人力物力上的优势进一步扩大。
重要的督抚大员变更，主要是陈荩接替了出任殿后军权将军的高一功为湖广经略使，为李来亨坐镇湖广大本营。原来的开封府府尹牛铨则升任河南节度使，官途不降反升。